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上海生命科學(xué)研究院最新pn


來源:農(nóng)資1號網(wǎng)      分類:農(nóng)資行情      時間:2011年11月21日      閱讀次數(shù):

上海生命科學(xué)研究院最新pnas文章 2011年06月17日09:41 生物通共有條評論摘要: 中科院上海生命科學(xué)研究院植生生態(tài)所植物分子遺傳國家重點實驗室的科研人員在新研究中發(fā)現(xiàn)了組蛋白變體h3.3分子中決定其嵌入核小體和從核小體上解離的信號氨基酸。相關(guān)研究論文于6月13日在線發(fā)表于美國《國家科學(xué)院院刊》(pnas)上。生物通報道中科院上海生命科學(xué)研究院植生生態(tài)所植物分子遺傳國家重點實驗室的科研人員在新研究中發(fā)現(xiàn)了組蛋白變體h3.3分子中決定其嵌入核小體和從核小體上解離的信號氨基酸。相關(guān)研究論文于6月13日在線發(fā)表于美國《國家科學(xué)院院刊》(pnas)上。高效轉(zhuǎn)染功能活性蛋白,fermentas推出最新產(chǎn)品,快來免費申請樣品!這篇論文的資深作者是中科院上海生命科學(xué)研究院植物生理生態(tài)研究所的方玉達(dá)研究員,其早年畢業(yè)于皖南農(nóng)學(xué)院,后于德國植物遺傳和作物研究所以及美國冷泉港實驗室攻讀博士后。近年來主要從事植物亞細(xì)胞核的結(jié)構(gòu)及功能研究工作。組蛋白變體嵌入核小體形成了結(jié)構(gòu)和功能各異的核小體,在生物體表觀遺傳過程中起非常重要的作用。組蛋白h3家族包括h3.1、h3.3和著絲粒特異的cenh3,它們在從果蠅到人類和植物中都非常保守。h3.3主要通過與一些分子伴侶如hira、daxx、atrx以及dek等作用,從而代替h3.1與轉(zhuǎn)錄活化的染色質(zhì)結(jié)合,在生殖細(xì)胞的發(fā)育、表觀遺傳記憶和染色質(zhì)重塑等方面發(fā)揮重要的作用。擬南芥組蛋白h3.3與h3.1只有四個氨基酸的不同,分別是n-端的31和41位以及組蛋白核心區(qū)的87和90位。通過對擬南芥組蛋白h3.3和h3.1及它們的突變蛋白在核仁rdna上精細(xì)的細(xì)胞生物學(xué)動態(tài)分析,方玉達(dá)領(lǐng)導(dǎo)的研究組提出和證實了這樣一個模型:即處于組蛋白h3.3核心區(qū)域的87位和90位氨基酸介導(dǎo)了核小體的組裝,而位于n端的31位和41位氨基酸則介導(dǎo)了核小體的去組裝。由于組蛋白變體h3.3及其相關(guān)的核小體在不同生物體中的高度保守性,因此該結(jié)果具有較廣泛的生物學(xué)意義。該工作得到了中國科學(xué)院知識創(chuàng)新工程、植物分子遺傳國家重點實驗室、國家自然科學(xué)基金等的支持。(生物通:何嬙)生物通推薦原文摘要:four amino acids guide the assembly or disassembly of arabidopsis histone h3.3-containing nucleosomesthe histone variant h3.3 and the canonical histone h3.1, which differ in only 4- to 5-aa positions, are coexpressed in complex multicellular eukaryotes from fly to human and plant. h3.3 is mainly associated with active chromatin by replacing h3.1 through chaperones such as histone regulator a, death domain associated protein daxx, thalassemia/mental retardation syndrome x-linked homolog atrx, or proto-oncogene protein dek and plays important roles in the germline, epigenetic memory, and reprogramming. however, the signals within h3.3 that serve as a guide for its dynamic deposition or depletion in plant chromatin are not clear. here, we show that arabidopsis histone h3.3 differs from h3.1 by 4-aa sites: amino acids 31, 41, 87, and 90. although histone h3.1 is highly enriched in chromocenters, h3.3 is present in nucleolar foci in addition to being diffusely distributed in the nucleoplasm. we have evaluated the function of the 4 aa that differ between h3.1 and h3.3. we show that amino acid residue 87, and to some extent residue 90, of arabidopsis histone h3.3 are critical for its deposition into rdna arrays. when rna polymerase i-directed nucleolar transcription is inhibited, wild type h3.3, but not h3.3 containing mutations at residues 31 and 41, is depleted from the rdna arrays. together, our results are consistent with a model in which amino acids 87 and 90 in the core domain of h3.3 guide nucleosome assembly, whereas amino acids 31 and 41 in the n-terminal tail of arabidopsis h3.3 guide nucleosome disassembly in nucleolar rdna.作者簡介:方玉達(dá)1985年7月畢業(yè)于皖南農(nóng)學(xué)院(現(xiàn)中國科學(xué)技術(shù)大學(xué))農(nóng)學(xué)系,獲學(xué)士學(xué)位。 2001年12月-2008年12月 美國冷泉港實驗室(cold spring harbor laboratory)博士后,從事: 1)活體植株內(nèi)亞細(xì)胞核結(jié)構(gòu)體的構(gòu)成、動態(tài)和功能研究;2)染色質(zhì)活體作圖(in vivo chromatin charting)研究。 1996年9月-1999年6月 在南京農(nóng)業(yè)大學(xué)細(xì)胞遺傳研究所學(xué)習(xí),獲博士學(xué)位。所學(xué)專業(yè):作物遺傳育種。從事二項研究:

一為含超大基因組的小麥-蔟毛麥6vs/6al易位系可轉(zhuǎn)化人工染色體(tac)文庫的構(gòu)建;二為轉(zhuǎn)幾丁質(zhì)酶煙草、蕃茄和小麥研究。 1999年7月-2001年11月 德國植物遺傳和作物研究所(institute of plant genetics and crop plant research gatersleben)博士后,從事植物轉(zhuǎn)基因細(xì)胞的活體跟蹤和大麥高效轉(zhuǎn)化體系的建立研究。 2009年1月-現(xiàn)在 在中國科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院植物生理和生態(tài)研究所從事植物細(xì)胞核功能性結(jié)構(gòu)和動態(tài)研究;任研究員,研究組長。從事植物亞細(xì)胞核的結(jié)構(gòu)和功能研究,內(nèi)容包括: (1)植物基因組和表觀基因組的四維(時序化三維)結(jié)構(gòu)及其與基因表達(dá)調(diào)控關(guān)系;(2)亞細(xì)胞核結(jié)構(gòu)域的鑒定和動態(tài)功能分析;(3)細(xì)胞核與細(xì)胞質(zhì)間的物質(zhì)轉(zhuǎn)運;(4)細(xì)胞核內(nèi)保有的非編碼rna的鑒定和功能分析; (5)細(xì)胞核體積大小與細(xì)胞體積、植株大小、生物質(zhì)積累成比例關(guān)系的分子細(xì)胞生物學(xué)機(jī)制。
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