云南完成鐵皮石斛基因精細(xì)圖譜 將有力推動全省石斛產(chǎn)業(yè)發(fā)展
人民網(wǎng)普洱9月4日電9月4日,記者從云南省普洱市普洱茶研究院重大科技成果新聞通氣會上獲悉,云南農(nóng)業(yè)大學(xué)聯(lián)合普洱市普洱茶研究院,在中國科學(xué)院昆明動物研究所的技術(shù)支持下,用一年半時間,完成了鐵皮石斛全基因組測序工作,繪制了鐵皮石斛的全基因精細(xì)圖譜。這是云南省主導(dǎo)完成的第一個植物基因組,同時也使鐵皮石斛成為第一個進行全基因組測序的藥食同用植物。
鐵皮石斛是云南省極具特色的珍稀高端藥用、食用植物。2012年底,云南石斛種植面積超過6萬畝,產(chǎn)值已達(dá)到30億元。2012年1月,在云南省科技廳的支持下,云南省成立了石斛產(chǎn)業(yè)技術(shù)創(chuàng)新戰(zhàn)略聯(lián)盟,并設(shè)立專項經(jīng)費開展了云南鐵皮石斛地理標(biāo)志研究、云南鐵皮石斛質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)研究、云南省石斛科技產(chǎn)業(yè)發(fā)展規(guī)劃以及鐵皮石斛基因組計劃等課題。
作為聯(lián)盟成員單位的云南農(nóng)業(yè)大學(xué)聯(lián)合普洱市普洱茶研究院,在中國科學(xué)院昆明動物研究所的技術(shù)支持下,以云南農(nóng)業(yè)大學(xué)盛軍校長(普洱市副市長)、昆明動物研究所王文研究員為課題組組長,全面展開了云南鐵皮石斛基因組計劃的實施。在普洱茶研究院嚴(yán)亮博士和昆明動物研究所董揚博士(現(xiàn)為昆明理工大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院教授)、王筱碩士的全力協(xié)同工作下,使用目前最新的第二代測序技術(shù)和近期剛剛引入國內(nèi)的第三代單分子測序技術(shù),用一年半時間,完成了鐵皮石斛全基因組測序工作,繪制了鐵皮石斛的全基因精細(xì)圖譜。目前,測序深度已達(dá)鐵皮石斛基因組大小的200倍,測序結(jié)果已覆蓋95%的全基因組和97%的基因編碼區(qū),超過國際上同行復(fù)雜基因測序的最高水平。研究組進一步解析了鐵皮石斛基因組中的基因信息,發(fā)現(xiàn)了48200多個蛋白質(zhì)編碼基因,其基因數(shù)目是目前所有已經(jīng)測序的植物中最多的,從基因水平證實了鐵皮石斛基因組的復(fù)雜性。
鐵皮石斛基因組精細(xì)圖譜的繪制完成,標(biāo)志著鐵皮石斛研究進入基因時代,同時也開啟了國際藥食同用植物基因組研究的新紀(jì)元。鐵皮石斛基因組精細(xì)圖譜的完成,為云南省鐵皮石斛行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)制定奠定了基礎(chǔ),也為中國從基因水平分析和制定鐵皮石斛標(biāo)準(zhǔn)提供了科學(xué)依據(jù)。鐵皮石斛的基礎(chǔ)研究和應(yīng)用開發(fā),必將進一步加快云南石斛產(chǎn)業(yè)的科學(xué)發(fā)展。
該項目發(fā)起人,云南農(nóng)業(yè)大學(xué)校長、普洱市副市長盛軍教授指出,鐵皮石斛基因組的完成,將會改變鐵皮石斛產(chǎn)業(yè)憑經(jīng)驗發(fā)展的現(xiàn)狀,為品種鑒定、基因育種、成分和功能研究以及新產(chǎn)品開發(fā)提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù),將持續(xù)推動云南石斛產(chǎn)業(yè)的可持續(xù)發(fā)展。該項目的另一負(fù)責(zé)人王文研究員認(rèn)為,鐵皮石斛基因組將為蘭科植物的起源、演化和特性研究提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù),作為第一個被解析的藥食同用植物基因組,也將進一步提振中藥的國際知名度,促進中草藥的現(xiàn)代化。
據(jù)了解,普洱市人民政府對鐵皮石斛基因組項目給予了大力支持,安排專項經(jīng)費用于鐵皮石斛全基因組測序研究。這也使普洱市成為了全國第一個支持基因組計劃的地級市,展現(xiàn)了普洱生態(tài)立市、綠色發(fā)展的決心。
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